Isto está com cara de Reindexação do Sistema.

Mas todo esse tempo UP depois da queda de energia e nada de terminar, com todo esse hardware, é muito estranho mesmo.

Bom quando acaba energia e o sistema volta, o Speedr tenta recuperar o sistema de arquivos e pode sobrecarregar os discos ao inicializar e usar CPU para fazer isso, como essas informações, como a latencia dos discos é uma média de tempo de resposta, isso tende a normalizar após algum tempo. Após recuperar o disco do sistema, ele começa a recuperar os discos de cache, portanto aparece a caixa amarela informando que o sistema esta recuperando os discos de cache e pode demorar até terminar dependendo da quantidade de informações nos discos.