Informax,

Verifique se essa placa mãe tem suporte a AHCI.

Tem sim, eu tinha me esquecido de habilitar, habilitei hoje, mas continua a mesma coisa.

Vamos lá,

Qual a quantidade de conexões simultâneas?
Qual Level de licença está usando?
quantos hd's estão instalados no servidor?
Qual o tipo de HD? ide, sata, scsi, sas?

No momento esta atigindo 4500 conexões simultaneas, eu tenho tenho licença de level 6 (7500), tenho um HD 500GB(Sistema Operacional) e 02 HD's de 1TB(Para o Cache), todos os HD's são sata.

Mesmo sendo uma maquina zero bala, faz testes de memoria, use alguma ISO de linux por exemplo o Ubuntu q contenha o memtest, pra mim é normal prestar assessoria e encontrar pentes de memoria bugados, mesmo sendo zero bala.
Outra coisa q vc pode fazer e desabilitar tudo oq vc nao ira usar no servidor, USB, Paralela, COM, rede ON, etc etc

Boa sorte

O teste de memória com recomendou o Paulo, usando memtest86, ou até mesmo no CD do ubuntu mesmo temo memtest86 pode ser util para identificar um possível problema com memória.

Se puder postar uma screeshot dos discos ai no momento da lentidão por exemplo, podemos ver se os discos estão respondendo bem.

Oi Henrique, eu fiz o teste de memoria com o Cd do Ubuntu 9.1 e nao deu nenhum erro, ai formatei o speedr para testar, pois os 2 HD's de cache estavam formatados mas ainda sim estava aparecendo arquivos em (Objetos Gravados)ai formatei o speedr, ai abri um chamado para voces fazerem a transferencia de creditos da licença.